ある日、突然世界が変わった

25年前に起きた目潰し連続殺人事件…当時14歳だった犯人の少年は今は社会に紛れて生活している…。そのニュースを見て笑う父の姿に覚えた僅かな違和感…それがすべての始まりだった…。

すべての人類が石と化す謎の現象に襲われた世界。石となった大樹は数千年間意識を失わず耐えてきた…。ついに石から目覚めた大樹は友人の千空とゼロから文明を作っていく事を決意する！

交番勤めの平凡な警官、蛇ヶ崎は同棲中の彼女と結婚して子供が生まれて…という近く訪れるだろう未来を退屈だと感じていた。つまらない日常をぶち壊したい、そう思っていたらそれは突然あっけなくぶち壊された…。

人の死の痕跡を清掃する特殊清掃業を生業とする春野。ある日、彼の師が連続猟奇殺人事件「END事件」に巻き込まれ殺されてしまう…。それをきっかけに事件の渦中に足を踏み入れる事となり…。

青年タイガは生きているという実感の乏しさを感じていた…。大学の卒業旅行で訪れたオーストラリアで偶然発見した洞窟…そこで崩落に襲われた彼らが辿り着いたのは古代の生物が思うままに闊歩する世界だった…。

外務省の外交官・真道は空港に突如出現した謎の立方体に飛行機ごと取り込まれてしまう。その中にいたのは謎の存在・ヤハクィザシュニナ…。それは「世界を推進する」ため、真道に人類との交渉を依頼してきて…。

富士山が噴火し、火山灰が降り続けている日本…。そんな中、高校生の善の学校で猫が殺される事件が起きる…。犯人に遭遇した善は信じられない光景を目の当たりにする事になる…。

新死刑法によって「公開処刑」が行われる事となり世間を賑わせていた頃、何者かに最愛の妻を殺害された冴村亮…。処刑人に追われる絶望的な状況下で妻を殺した真犯人を追う事を決意する…！

将来有望な精神科医の桜井は大規模テロ組織のリーダーがかつての友人・ユキオである事を知る。彼が兄の死に関わっていたのではと疑惑を抱き始めた時、ユキオの精神鑑定に立ち会う事となり…。

平凡な毎日を過ごす和也の元に『βl@ck★OUT』というゲームが届く…。日々に何か刺激がほしい…漠然とそう願っていた彼は、クリアするか死か、逃れられないデスゲームへと足を踏み入れる事となる…。